Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCLRE1CQ96SD1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCLRE1CQ96SD1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms