Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms