Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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