Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms