Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms