Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms