Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD4Q96M96 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms