Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms