Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms