Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms