Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms