Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms