Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms