Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP3Q96KP6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.6 ms