Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABS1Q96KC9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CABS1Q96KC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms