Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms