Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms