Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RNF185Q96GF1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RNF185Q96GF1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RNF185Q96GF1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RNF185Q96GF1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RNF185Q96GF1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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RNF185Q96GF1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RNF185Q96GF1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF185Q96GF1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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RNF185Q96GF1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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