Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms