Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
VOPP1Q96AW1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VOPP1Q96AW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms