Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms