Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRF1Q92994 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms