Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms