Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRUQ92729 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms