Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms