Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms