Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAT3Q8TDW7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAT3Q8TDW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms