Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACER1Q8TDN7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms