Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCD1

C18orf32, UPF0729 protein C18orf32, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf32Q8TCD1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf32Q8TCD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms