Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD1Q8NHV4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms