Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF397Q8NF99 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms