Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIEQ8NEW7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIEQ8NEW7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms