Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM3Q8NE01 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM3Q8NE01 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms