Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms