Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms