Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AVL9Q8NBF6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms