Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMER3Q8N944 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMER3Q8N944 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms