Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms