Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN19Q8N6F1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CLDN19Q8N6F1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CLDN19Q8N6F1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN19Q8N6F1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CLDN19Q8N6F1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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CLDN19Q8N6F1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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CLDN19Q8N6F1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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CLDN19Q8N6F1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLDN19Q8N6F1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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CLDN19Q8N6F1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLDN19Q8N6F1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLDN19Q8N6F1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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CLDN19Q8N6F1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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CLDN19Q8N6F1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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