Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms