Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC6Q7Z403 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMC6Q7Z403 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC6Q7Z403 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC6Q7Z403 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC6Q7Z403 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC6Q7Z403 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC6Q7Z403 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms