Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms