Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYFIP1Q7L576 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms