Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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