Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF493Q6ZR52 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms