Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms