Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms