Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms