Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf88Q6PI97 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf88Q6PI97 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms