Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms